（1）分散屠杀
南京大屠杀油画，《东京日日新闻》（即现在《每日新闻》）报道两名日本军官的“杀人竞赛”。日军第十六师团中岛部队两个少尉军官向井敏明和野田毅在其长官鼓励下，彼此相约“杀人竞赛”，商定在占领南京时，谁先杀满100人为胜者。他们从句容杀到汤山，向井敏明杀了89人，野田毅杀了78人，因皆未满100，“竞赛”继续进行。12月10日中午，两人在紫金山下相遇，彼此军刀已砍缺了口。野田谓杀了105人，向井谓杀了106人。又因确定不了是谁先达到杀100人之数，决定这次比赛不分胜负，重新比赛谁杀满150名中国人。这些暴行都一直在报纸上图文并茂连载，被称为“皇军的英雄”。日本投降后，这两个战犯终以在作战期间，共同连续屠杀俘虏及非战中人员“实为人类蟊贼，文明公敌”的罪名在南京执行枪决。
（2）奸淫
图为被日军轮奸后的南京妇女的惨状秀英趟在鼓楼医院的病床上。1937年12月，当时18岁的孕妇李秀英躲藏在南京安全区的一个地下室内。19日，日军士兵闯入地下室企图***这里的妇女，李秀英在反抗中被刺伤三十多刀，胎儿流产！
据估计，在日军占领南京之后一至两个月内，约有2万至8万名中国妇女遭到日军***。日军不分昼夜并在受害妇女的家人面前施行强暴，被***的妇女甚至包括12岁的幼女、60岁的老妇，乃至孕妇。很多妇女受到了轮奸，有些妇女甚至会被日军***数次，类似的事件往往导致有妇女受不住日军的折磨而死。受害人或是试图保护她的亲属如果稍有反抗，往往就被日军杀死，母亲身边的孩子因为哭闹也经常被日军一并杀害。此外，日军还强迫乱伦行为，不从就加以杀害。日军对妇女的大规模***和虐杀直到1938年2月才有所收敛。约翰·马吉牧师详细记录了一起典型的***灭门惨案。
12月13日，30个日兵闯入夏淑琴一家与房东居住的门东新路口5号，他们先杀死了房东夫妻和夏淑琴的父亲，用刺刀杀死了夏淑琴母亲怀里的1岁婴儿，之后轮奸了母亲和另一个房间里16岁、14岁的两个姐姐，她的祖父母在试图保护孙女的时候被杀死。之后日兵杀死了惨遭奸淫的母女，并且在她们的阴道里插进瓶子和木棍。当时7岁的夏淑琴和她4岁的妹妹被刺刀扎伤，她们因为昏死过去而幸存下来。